מדינת ישראל עושה שימוש במים מחמישה מקורות מים עיקריים: אגם הכינרת, אקוות החוף, אקוות ההר, מי ים שעברו התפלה ומים מושבים. במשך רוב שנות קיומה של המדינה היוותה הכנרת את מקור המים המרכזי ביותר, וסיפקה לבדה כ – 25% מצריכת המים בישראל. עם זאת, בשל תהליכים טבעיים ופעילות אדם, המשפיעים על כמות המים הניתנת לשאיבה מהאגם, עובר המגזר החקלאי בשנים האחרונות בהדרגה להשקיה המתבססת על מי קולחים ומים מליחים מותפלים. משמעותו של מעבר זה היא ירידה מסוימת במרכזיותה של הכנרת במשק המים בישראל.
גורם נוסף המשפיע בצורה ניכרת על התפתחות משק המים בישראל הוא הגידול המשמעותי בביקוש למים. גידול זה, שמקורו במגזר הביתי ובמגזר התעשייתי, מעלה צורך בפיתוח של מקורות מים נוספים, לשם שמירה על אספקת מים סדירה. חברת מקורות פועלת באפיק זה באמצעות בנייה של מתקני השבת קולחין ומתקני התפלת מים מליחים, ובאמצעות פיתוח של טכנולוגיות מים חדישות והשקעה בתחום הקלינטק, המאפשרות שיפור של תפוקת המים.